Sœur Eugénie Joubert se dépensait sans compter en tant que catéchiste pour les enfants et les jeunes, en particulier les plus pauvres et les plus abandonnés, fidèle en cela à l’esprit de la Congrégation de la Sainte Famille du Sacré-Cœur.
Elle allait même au-delà, se consacrant à une vie d’apostolat. Elle s’intéressait avant tout à tous ceux qui, dépourvus de tout moyen naturel, exigeaient d’elle beaucoup de patience. Sans se lasser, elle répétait les demandes essentielles du catéchisme mises très simplement à la portée des enfants et des jeunes. A force de prière et de vie intérieure, Sœur Eugénie Joubert aimait à faire passer dans le cœur des enfants instruits par elle, quelque chose du feu d’amour qui étreignait le sien.